Для того чтобы отвязать подчиненную базу от главного узла, нужно запустить 1с (версия не младше 8.3.12) с параметром 
/ResetMasterNode

Процедура КнопкаВыполнитьНажатие(Кнопка)
 // Вставить содержимое обработчика.
Для каждого Документ  Из Метаданные.Документы Цикл
  Выборка = ПланыОбмена.ВыбратьИзменения(УзелОбмена,УзелОбмена.НомерОтправленного+1,Документ);
     Пока Выборка.Следующий() Цикл
       Объект = Выборка.Получить();
      Если Объект.Дата <= Дата('20171231235959')  ИЛИ Объект.Дата >= Дата('20190101000000') Тогда
         ПланыОбмена.УдалитьРегистрациюИзменений(УзелОбмена,Объект.Ссылка);
      КонецЕсли; 
  КонецЦикла; 
 КонецЦикла; 
КонецПроцедуры

Процедура ХозрасчетныйНажатие(Элемент)
 Запрос = Новый Запрос;
 Запрос.Текст = 
  "ВЫБРАТЬ
  | Хозрасчетный.Регистратор.Ссылка КАК Ссылка
  |ИЗ
  | РегистрБухгалтерии.Хозрасчетный КАК Хозрасчетный
  |ГДЕ
  | (Хозрасчетный.Регистратор.Дата >= &Дата1
  |   ИЛИ Хозрасчетный.Регистратор.Дата <= &Дата2)";
 
 Запрос.УстановитьПараметр("Дата1", Дата('20190101000000'));
 Запрос.УстановитьПараметр("Дата2", Дата('20171231235959'));
 
 РезультатЗапроса = Запрос.Выполнить();
 
 ВыборкаД = РезультатЗапроса.Выбрать();
 ТЗ = РезультатЗапроса.Выгрузить();
 Индекс = 0;
 Пока Индекс < ТЗ.Количество()+1    Цикл
  Если ВыборкаД.Следующий() Тогда
  Рег = РегистрыБухгалтерии.Хозрасчетный;
  НаборЗаписей = Рег.СоздатьНаборЗаписей();
  НаборЗаписей.Отбор.Регистратор.Значение = ВыборкаД.Ссылка;
  НаборЗаписей.Прочитать();
  ПланыОбмена.УдалитьРегистрациюИзменений(УзелОбмена,НаборЗаписей);
  Индекс = Индекс + 1;
  КонецЕсли;
 КонецЦикла;
 
КонецПроцедуры

Процедура РегСврДанныеПервичныхДокументовНажатие(Элемент)
 Запрос = Новый Запрос;
 Запрос.Текст = 
  "ВЫБРАТЬ
  | ДанныеПервичныхДокументов.Документ.Ссылка КАК Документ,
  | ДанныеПервичныхДокументов.Организация.Ссылка КАК Организация
  |ИЗ
  | РегистрСведений.ДанныеПервичныхДокументов КАК ДанныеПервичныхДокументов
  |ГДЕ
  | (ДанныеПервичныхДокументов.Дата >= &Дата1
  |   ИЛИ ДанныеПервичныхДокументов.Дата <= &Дата2)";
 
 Запрос.УстановитьПараметр("Дата1", Дата('20190101000000'));
 Запрос.УстановитьПараметр("Дата2", Дата('20171231235959'));
 
 РезультатЗапроса = Запрос.Выполнить();
 
 ВыборкаД = РезультатЗапроса.Выбрать();
 ТЗ = РезультатЗапроса.Выгрузить();
 Индекс = 0;
 НаборЗаписей = РегистрыСведений.ДанныеПервичныхДокументов.СоздатьНаборЗаписей();
 Пока Индекс < ТЗ.Количество()+1    Цикл
     Если ВыборкаД.Следующий() Тогда
        НаборЗаписей.Отбор.Организация.Значение = ВыборкаД.Организация;
        НаборЗаписей.Отбор.Организация.Использование = Истина;
        НаборЗаписей.Отбор.Документ.Значение = ВыборкаД.Документ;
        НаборЗаписей.Отбор.Документ.Использование = Истина;
     КонецЕсли;
  Индекс = Индекс + 1;
 КонецЦикла;
КонецПроцедуры

Симптомы: 1. Конфигурация узла распределенной ИБ не соответствует ожидаемой Что делать:

Центральная БД

1. Выгоняем всех пользователей из цетральной БД.
2. Изменяем БД. Нужно добиться пересчета цифровой подписи БД. Для этого:
   1. Вносим символические изменения в БД, например в какой-нибудь роли нужно снять поставить какую-нибудь галочку
   2. Сохраняем изменения в БД
3. выгружаем данные в узлы

Узловые БД

1. Применяем обновление в узлах
2. Делаем синхронизацию. Все должно работать.

Центральная БД

1. Выгоняем всех пользователей из цетральной БД.
2. Изменяем БД. Нужно добиться пересчета цифровой подписи БД. Для этого:
   1. Вносим символические изменения в БД, например в какой-нибудь роли нужно снять поставить какую-нибудь галочку
   2. Сохраняем изменения в БД
3. Выгружаем конфигурацию БД в файл, заливаем его в узлы

Узловые БД

1. Для заливки конфигурации, нужно отвязать узел от центра, для этого запустим конфигуратор с ключом: /ResetMasterNode
2. Запускаем конфигуратор еще раз Загружаем конфигурацию из файла
3. Запускаем в режиме Предприятия, соглашаемся на восстановление РИБ, делаем обмен, все должно работать.

Вариант 3. С инфостарта. Вот ссылка на сабж с заменой цифровой подписи БД. У автора все сработало. Сам не проверял.